CRISPR Point Mutation 点突变

通过同义突变 donor 在目标氨基酸两侧引入标记,HR 修复精准实现氨基酸位点替换。

原理 · 流程 · 优势 · 适用 · 风险

技术原理

根据目标转录本和突变位点,设计邻近且脱靶风险较低的 gRNA。Cas9 在目标区域产生 DNA 双链断裂,细胞以含目标突变和同源臂的 donor DNA 为模板,通过同源定向修复(HDR)将指定序列写入基因组。若目标突变本身不能阻止 Cas9 再次识别,可在 PAM 或 gRNA seed 区加入最少量、经评估的同义阻断突变,以降低修复后再次切割的风险,并辅助分子筛选。

工作流程
项目评估与方案设计 Target 测序 注射样品制备 显微注射 杂交鉴定 稳定系/纯合系构建
核心优势
  • 单氨基酸精准替换:可定向改变单个氨基酸残基,不影响上下游序列与蛋白整体结构
  • 原版背景保真:仅替换目标位点,保留基因天然调控元件与表达模式,避免整段删除或标签融合的副作用
  • 灵活设计阻断突变:可在 PAM 或 gRNA seed 区加入最少量同义阻断突变,显著降低修复后再次切割风险
  • 分子筛选便利:同义阻断突变天然引入限制性酶切位点或 PCR 标识,便于筛选与建系鉴定
典型适用
疾病位点建模 关键氨基酸功能验证 蛋白功能域定点改造 进化保守位点功能研究
风险与限制
  • HDR 效率较低:单氨基酸替换依赖 HR 而非 NHEJ,整体敲入效率显著低于 Indel/KO,需要更多胚胎注射量和精细筛选
  • 同义阻断突变引入风险:在 PAM 或 gRNA seed 区加入的同义阻断突变虽不改变氨基酸,仍需评估对 mRNA 折叠、剪接或翻译效率的潜在影响
  • 候选位点受限:需在 gRNA 切割位点附近存在合适的同义突变空间,且目标氨基酸位于 PAM 上下游合理距离内
  • 验证依赖 Sanger 测序:点突变改造需通过 Sanger 测序确认替换边界和同义突变引入准确性,周期与成本较 Indel 更高

技术原理

HDR 介导的精准氨基酸替换

针对目标氨基酸位点设计 gRNA 并构建含同义突变 + 同源臂的 donor DNA,通过 HDR 将目标氨基酸位点精准替换为目标残基,同时通过同义突变在两侧引入辅助筛选标记。

若目标突变本身不能阻止 Cas9 再次识别,可在 PAM 或 gRNA seed 区加入最少量、经评估的同义阻断突变,以降低修复后再次切割的风险,并辅助分子筛选与建系。

CRISPR Point Mutation 点突变原理示意:通过同义突变 donor 在目标氨基酸两侧引入标记,HR 修复精准替换氨基酸位点

实验流程

CRISPR Point Mutation 6 阶段流程表:target 测序 → gRNA 和 cas9-mRNA 合成制备 → donor 质粒载体构建 → 显微注射 → 杂交鉴定和构建稳定品系,合计 13~16 周